日本在留卡会被退吗？
在留下达后，如果签证到期未离境，会有可能被拒绝入境并列入黑名单。 日本《入出境法令》中规定，对于逾期不报或者非法居留的外国人，可以处以10万日圆以下（约6500人民币元）罚金；情节严重的，处以7年以下有期徒刑或拘役； 同时被处以上述刑罚之外，还可以给予开除学籍、开除公职等行政处分；对构成犯罪的犯罪分子，依法追究刑事责任。
所以楼主的情况目前应该先和学校的国际交流科确认怎么处理（毕竟你逾期不归，学校也有责任让你回国的吧……）；然后向使馆咨询，因为你是以留学的方式去日本的，所以需要和大使馆确认是否影响以后留学申请。 一般来讲，大使馆不会直接拒绝你的签证申请的，他们只是会审查你是否符合他们的申请条件。所以只要你和院校方面能搞定，大使馆是没理由拒绝你的申请的。当然，如果你是因为材料没有准备齐全或者其他原因导致被拒签的，那就得另外分析了。
会被退。在留卡（Japanese Residence Card）是日本为在日方居住的外籍人士发放的一种居住许可证。如果在居留许可有效期到期、申请被取消、申请人不再符合居留条件等情况，日本入境管理局就会注销或撤销该居留许可，并回收在留卡。
常见的在留卡被退的情况包括：
1. 延长停留期限的申请被拒绝
2. 签证或者居留许可有效期到期
3. 没有按时更新住所或者签证信息
4. 违反日本法律法规，例如非法打工，非法逗留等
5. 税赋有拖欠，例如拖欠个人所得税、国民社会保障税等
6. 一方的离婚，致使境外逗留的理由消失
7. 申请人不再符合居留日本的资格或者条件
8. 自愿退学或者退学
总之，在留卡被注销或退回的原因是多方面的，主要表现为当事人无法继续满足在日本居留的条件。
